این کلیسا که در محلهی میدان جلفا و در مجاورت کلیسای مریم مقدس قرار گرفته در سال ۱۶۰۷م بنا شده و قدیمیترین کلیسای ارمنیان جلفای اصفهان محسوب میشود.
پلان اولیهی کلیسا به شکل صلیب بوده که به علت تخریب بازوی جنوبی آن در سال ۱۸۴۳م به شکل مستطیلی در جهت شرقی غربی با ابعاد ۲/۱۲Ï۹/۳ متر درآمده. سه گنبد کوچک قوسی شکل آن و سقف بنا بر روی قوسهایی تکیه کردهاند که بر روی ستونهای پهن متصل به دیوارهای شمالی و جنوبی قرار دارند. از سه گنبد کوچک بنا گنبد میانی نسبتاً بزرگتر است. مصالح به کار رفته در ساختمان عبارت اند از خشت و آجر. دیوارهای داخلی با گچ و دیوارهای خارجی با کاهگل پوشانده شدهاند. در بالای ورودی اصلی کلیسا نیز دو کتیبه به زبان ارمنی مربوط به سال ۱۶۰۷م وجود دارد.